Organizarea bisericeasca in Moldova este anterioara anului 1386, in care se face prima atestare a Mitropoliei Moldovlahiei. Sirul mitropolitilor Moldovei incepe cu Iosif Musat, de care este legata si neintelegerea cu Patriarhia Ecumenica in privinta recunoasterii validitatii hirotoniei sale. Pe 26 iulie anul 1401, cand s-a incheiat conflictul, Mitropolia Moldovei reintra in randul Bisericilor Ortodoxe, dupa aproape un deceniu in care a fost sub anatema Patriarhiei de la Constantinopol.
Dintre mitropolitii de seama ai Moldovei amintim pe Varlaam, Dosoftei, Veniamin Costachi, si patriarhi ai Romaniei: Nicodim Munteanu, Iustinian Marina si Prea Fericitul Parinte Teoctist Arapasu.
In prezent de la 1 iulie 1990 Mitropolit al Moldovei si Bucovinei este Inalt Prea Sfintitul Dr. Daniel Ciobotea. Denumirea Mitropolia Moldovei si Sucevei a fost schimbata in Mitropolia Moldovei si Bucovinei in anul 1990 de catre Sfantul Sinod al Bisericii Ortodoxe Romane.
